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PfamScan

2011年 功能注释 结构域方法

PfamScan

基于 Pfam 蛋白家族数据库和 HMM profile 的结构域注释工具,可识别蛋白序列中的保守结构域与功能模块。 该方法常与 HMMER 联合使用,为蛋白功能推断、家族分类和结构域组合分析提供标准化结果。
:material-target: 用途
基于 Pfam profile 进行蛋白结构域识别与功能注释
:material-clock-fast: 时间复杂度
O(mn)
:material-memory: 空间复杂度
O(m)

相关工具

HMMER · InterProScan · SMART

标签

[domain-detection](tags.md#domain-detection) [pfam](tags.md#pfam) [protein-family](tags.md#protein-family) [profile-hmm](tags.md#profile-hmm)

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