Prodigal¶
2010年 基因预测 原核基因预测 入门 (Beginner)
Prodigal
高效的原核基因识别工具，使用动态规划和自训练策略自动学习物种特异性编码偏好性进行基因预测。 该方法无需外部训练数据即可准确预测蛋白编码基因，支持宏基因组模式处理混合物种组装数据。
:material-target: 用途
原核生物蛋白编码基因的快速从头预测
:material-clock-fast: 时间复杂度
O(n):material-memory: 空间复杂度
O(n):material-code: 实现语言
C
相关工具¶
GeneMark · Glimmer · FragGeneScan
标签¶
[gene-prediction](tags.md#gene-prediction) [prokaryotic](tags.md#prokaryotic) [fast](tags.md#fast) [metagenome](tags.md#metagenome)