RagTag¶
2022年 序列组装 参考引导组装
RagTag
基于参考基因组进行 scaffold 排序、定向和纠错的组装改进工具，常用于提升草图组装的连续性和完整度。 该方法能够快速将 contig 锚定到近缘参考序列，为植物和动物基因组装配提供高效的参考引导整理能力。
:material-target: 用途
基于参考基因组改进 scaffold 排序与定向
:material-clock-fast: 时间复杂度
O(n log n):material-memory: 空间复杂度
O(n)相关工具¶
Ragout · RaGOO · Minimap2
标签¶
[reference-based](tags.md#reference-based) [scaffolding](tags.md#scaffolding) [assembly-polishing](tags.md#assembly-polishing) [genome-finishing](tags.md#genome-finishing)