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Reference-Guided Assembly

2011年 序列组装 参考引导组装

Reference-Guided Assembly

基于参考基因组的序列组装方法,将测序读段先比对到参考序列上,再进行局部组装和变异检测。 该方法适合有近缘参考基因组的物种,组装速度快且资源消耗低,常用于重测序项目。
:material-target: 用途
基于参考序列的快速基因组组装
:material-clock-fast: 时间复杂度
O(n log n)
:material-memory: 空间复杂度
O(n)

相关工具

Ragout · RaGOO · RagTag

标签

[reference-based](tags.md#reference-based) [scaffolding](tags.md#scaffolding) [resequencing](tags.md#resequencing) [efficient](tags.md#efficient)

:material-folder: 分类:序列组装 / 参考引导组装 | :material-identifier: ID:reference-guided-assembly