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REGENIE

2021年 群体遗传学 全基因组关联分析 进阶 (Intermediate)

REGENIE

两阶段回归框架的大规模关联分析工具,先用全基因组回归预测个体的基因背景, 再进行逐位点的关联检验。该方法计算效率极高,适用于百万级别的生物银行数据。
:material-target: 用途
两阶段大规模全基因组关联分析
:material-clock-fast: 时间复杂度
O(n * m)
:material-memory: 空间复杂度
O(n * m)
:material-code: 实现语言
C++

相关工具

BOLT-LMM · SAIGE · GCTA

标签

[gwas](tags.md#gwas) [scalable](tags.md#scalable) [two-stage](tags.md#two-stage) [biobank](tags.md#biobank)

:material-folder: 分类:群体遗传学 / 全基因组关联分析 | :material-identifier: ID:regenie