REGENIE¶
2021年 群体遗传学 全基因组关联分析 进阶 (Intermediate)
REGENIE
两阶段回归框架的大规模关联分析工具,先用全基因组回归预测个体的基因背景, 再进行逐位点的关联检验。该方法计算效率极高,适用于百万级别的生物银行数据。
:material-target: 用途
两阶段大规模全基因组关联分析
:material-clock-fast: 时间复杂度
O(n * m):material-memory: 空间复杂度
O(n * m):material-code: 实现语言
C++
相关工具¶
BOLT-LMM · SAIGE · GCTA
标签¶
[gwas](tags.md#gwas) [scalable](tags.md#scalable) [two-stage](tags.md#two-stage) [biobank](tags.md#biobank)