RNAmmer¶
2007年 基因预测 原核基因预测 进阶 (Intermediate)
RNAmmer
核糖体 RNA 基因预测工具,利用隐马尔可夫模型从基因组序列中精确识别 5S、16S 和 23S rRNA 基因及其前体。 该方法是微生物基因组注释流程中的重要组件,为系统发育分析和宏基因组分类提供必需的 rRNA 序列信息。
:material-target: 用途
基因组中核糖体 RNA 基因的精确预测
:material-clock-fast: 时间复杂度
O(n * s):material-memory: 空间复杂度
O(n):material-code: 实现语言
Perl、C
相关工具¶
Barrnap · BLAST · SILVA
标签¶
[rrna](tags.md#rrna) [gene-prediction](tags.md#gene-prediction) [hmm](tags.md#hmm) [ribosomal](tags.md#ribosomal)