RSEM¶
2011年 基因表达分析 表达定量
RSEM
基于参考转录组的转录本定量工具,使用期望最大化算法估计转录本丰度。 该方法能够处理多重比对读段并提供转录本和基因水平的表达量估计,适合需要高精度定量的场景。
:material-target: 用途
基于参考的转录本定量
:material-clock-fast: 时间复杂度
O(n * t):material-memory: 空间复杂度
O(t)相关工具¶
Salmon · Kallisto · Sailfish
标签¶
[quantification](tags.md#quantification) [expectation-maximization](tags.md#expectation-maximization) [rna-seq](tags.md#rna-seq) [reference-based](tags.md#reference-based)