Salmon¶
2017年 基因表达分析 表达定量
Salmon
基于选择性比对的高速转录本定量工具，使用轻量级比对和在线 EM 算法估计转录本丰度。 该方法速度极快且内存占用低，能够校正 GC 含量偏差和序列特异性偏差。
:material-target: 用途
快速准确的转录本定量
:material-clock-fast: 时间复杂度
O(n):material-memory: 空间复杂度
O(t)相关工具¶
Kallisto · RSEM · Sailfish
标签¶
[selective-alignment](tags.md#selective-alignment) [quantification](tags.md#quantification) [rna-seq](tags.md#rna-seq) [fast](tags.md#fast)