SCENIC¶
2020年 单细胞基因组学 细胞聚类与注释 高级 (Advanced)
SCENIC
单细胞基因调控网络推断方法，通过整合共表达模块和转录因子结合基序信息识别细胞状态特异性调控关系。 该方法能从单细胞表达矩阵中自动发现活性转录因子及其调控靶基因，是研究细胞异质性调控机制的重要工具。
:material-target: 用途
单细胞基因调控网络推断与分析
:material-clock-fast: 时间复杂度
O(c * g^2):material-memory: 空间复杂度
O(c * g):material-code: 实现语言
Python、R
相关工具¶
Scanpy · Seurat · GRNBoost
标签¶
[regulatory-network](tags.md#regulatory-network) [transcription-factor](tags.md#transcription-factor) [grn](tags.md#grn) [gene-regulatory](tags.md#gene-regulatory)