seqwish¶
2020年 图基因组学 泛基因组 高级 (Advanced)
seqwish
从全对全比对结果构建无损变异图的工具，将比对中的所有对齐关系编码为 图结构。该方法是 PGGB 工作流的核心组件，保证不丢失任何序列和比对信息。
:material-target: 用途
从比对结果构建无损变异图
:material-clock-fast: 时间复杂度
O(n^2):material-memory: 空间复杂度
O(n^2):material-code: 实现语言
C++
相关工具¶
PGGB · odgi · Minigraph
标签¶
[pangenome](tags.md#pangenome) [graph-construction](tags.md#graph-construction) [alignment-to-graph](tags.md#alignment-to-graph) [lossless](tags.md#lossless)