SPARK¶
2019年 空间组学 空间转录组学 进阶 (Intermediate)
SPARK
基于广义线性混合模型的空间可变基因检测方法，通过建模空间表达模式的 零膨胀和过度离散特征来识别空间相关表达的基因。该方法统计学基础扎实， 假阳性控制良好。
:material-target: 用途
统计学方法检测空间可变基因
:material-clock-fast: 时间复杂度
O(g * n^2):material-memory: 空间复杂度
O(n^2):material-code: 实现语言
R
相关工具¶
SpatialDE · trendsceek · SPARK-X
标签¶
[spatial](tags.md#spatial) [spatially-variable-gene](tags.md#spatially-variable-gene) [statistical](tags.md#statistical) [glm](tags.md#glm)