SpatialDE¶
2018年 空间组学 空间转录组学 高级 (Advanced)
SpatialDE
基于高斯过程回归的空间可变基因检测方法，通过拟合空间表达的协方差函数 来检测基因表达是否具有空间模式。该方法可同时识别周期性和非周期性的 空间表达模式。
:material-target: 用途
高斯过程方法检测空间表达模式
:material-clock-fast: 时间复杂度
O(g * n^2):material-memory: 空间复杂度
O(n^2):material-code: 实现语言
Python
相关工具¶
SPARK · trendsceek · merfish
标签¶
[spatial](tags.md#spatial) [gaussian-process](tags.md#gaussian-process) [pattern-detection](tags.md#pattern-detection) [probabilistic](tags.md#probabilistic)