SPRING Compress¶
2020年 数据压缩 专用压缩 进阶 (Intermediate)
SPRING Compress
针对大规模 FASTQ 数据集开发的重排序压缩工具，通过读段排序和参考序列编码实现极高的压缩比。 该方法能够处理海量测序数据，在百万级乃至亿级读段规模下仍保持高效的压缩性能和可接受的运行时间。
:material-target: 用途
大规模 FASTQ 数据集的高比率重排序压缩
:material-clock-fast: 时间复杂度
O(n log n):material-memory: 空间复杂度
O(n):material-code: 实现语言
C++
相关工具¶
SPRING · fqzcomp · Genozip
标签¶
[fastq](tags.md#fastq) [reordering](tags.md#reordering) [high-ratio](tags.md#high-ratio) [scalable](tags.md#scalable)