Squidpy¶
2021年 空间组学 空间转录组学 进阶 (Intermediate)
Squidpy
专注于空间组学数据分析的 Python 工具包,提供空间邻域图构建、空间富集分析、 细胞通讯推断和图像分析等功能。该工具与 Scanpy 深度集成,支持多种空间平台。
:material-target: 用途
空间组学数据的图分析和图像整合
:material-clock-fast: 时间复杂度
O(c * g):material-memory: 空间复杂度
O(c * g):material-code: 实现语言
Python
相关工具¶
Scanpy · Giotto · stLearn
标签¶
[spatial](tags.md#spatial) [graph-analysis](tags.md#graph-analysis) [cell-interaction](tags.md#cell-interaction) [image-analysis](tags.md#image-analysis)