STARsolo¶
2021年 单细胞基因组学 数据预处理
STARsolo
基于 STAR 比对器扩展的单细胞 RNA-seq 预处理方法，可在一次流程中完成比对、细胞条码解析和 UMI 计数。 该工具兼具高速度与对 10x 等主流协议的兼容性，是 Cell Ranger 之外的重要开源替代方案。
:material-target: 用途
单细胞 RNA-seq 数据的快速比对与表达矩阵生成
:material-clock-fast: 时间复杂度
O(n * g):material-memory: 空间复杂度
O(c * g)相关工具¶
Cell Ranger · Alevin · Kallisto-bustools
标签¶
[preprocessing](tags.md#preprocessing) [alignment](tags.md#alignment) [umi](tags.md#umi) [open-source](tags.md#open-source)