StringTie¶
2015年 基因表达分析 表达定量
StringTie
高效的转录本组装和丰度估计工具，使用网络流算法从 RNA-seq 比对结果中重构转录本结构。 该方法能够准确组装新的转录本异构体并估计其表达量，是转录组分析流程中的核心组件。
:material-target: 用途
转录本组装与丰度估计
:material-clock-fast: 时间复杂度
O(n):material-memory: 空间复杂度
O(g)相关工具¶
STAR · HISAT2 · Cufflinks
标签¶
[transcript-assembly](tags.md#transcript-assembly) [quantification](tags.md#quantification) [rna-seq](tags.md#rna-seq) [splice-aware](tags.md#splice-aware)