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SvABA

2016年 变异检测 结构变异

SvABA

基于局部组装的结构变异和体细胞突变检测工具,能够同时识别生殖系和体细胞的结构变异事件。 该方法通过断点图和单倍型组装精确定位变异断点,适用于癌症基因组学中的复杂变异检测。
:material-target: 用途
基于局部组装的结构变异和体细胞突变检测
:material-clock-fast: 时间复杂度
O(n * c)
:material-memory: 空间复杂度
O(c)

相关工具

Manta · GRIDSS · Delly

标签

[structural-variant](tags.md#structural-variant) [somatic](tags.md#somatic) [assembly-based](tags.md#assembly-based)

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