tximport¶
2016年 基因表达分析 表达定量 入门 (Beginner)
tximport
从轻量级比对工具的输出导入转录本定量结果并汇总到基因水平的工具。该方法 使用偏移量校正来处理转录本长度变化对基因水平定量的影响，是 Salmon/Kallisto 与 DESeq2/edgeR 之间的桥梁工具。
:material-target: 用途
转录本定量结果导入和基因水平汇总
:material-clock-fast: 时间复杂度
O(n * t):material-memory: 空间复杂度
O(g):material-code: 实现语言
R
相关工具¶
Salmon · Kallisto · DESeq2
标签¶
[import](tags.md#import) [summarization](tags.md#summarization) [offset-correction](tags.md#offset-correction) [bioconductor](tags.md#bioconductor)