Unicycler¶
2017年 序列组装 从头组装 进阶 (Intermediate)
Unicycler
基于 SPAdes 和 miniasm 的混合组装工具，先用短读段构建骨架图，再用长读段解决重复区域。该方法对细菌基因组的组装质量极高，可产生完整的环形染色体序列。
:material-target: 用途
细菌基因组的高质量混合组装
:material-clock-fast: 时间复杂度
O(n log n):material-memory: 空间复杂度
O(n):material-code: 实现语言
Python、C++
相关工具¶
SPAdes · Flye · MaSuRCA
标签¶
[hybrid](tags.md#hybrid) [bacterial](tags.md#bacterial) [circular](tags.md#circular) [short-read-first](tags.md#short-read-first)