Verkko¶
2023年 序列组装 从头组装 高级 (Advanced)
Verkko
端粒到端粒级别的基因组组装工具，整合 PacBio HiFi 高精度长读段和 ONT 超长读段实现完整基因组组装。 该方法能够填补参考基因组中的间隙，产生无间隙的端粒到端粒组装结果，是目前最完整的组装策略之一。
:material-target: 用途
整合 HiFi 和 ONT 数据实现端粒到端粒组装
:material-clock-fast: 时间复杂度
O(n log n):material-memory: 空间复杂度
O(n):material-code: 实现语言
C++
相关工具¶
Hifiasm · HiCanu · Flye
标签¶
[t2t](tags.md#t2t) [hybrid](tags.md#hybrid) [hifi](tags.md#hifi) [telomere-to-telomere](tags.md#telomere-to-telomere)