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VG (Variation Graph)

2017年 图基因组学 变异图 高级 (Advanced)

VG (Variation Graph)

基于变异图的基因组分析工具包,将基因组序列和群体变异编码为有向图结构, 支持图上的序列比对和变异检测。该方法可处理参考基因组偏差,提供更公平 的比对和变异调用。
:material-target: 用途
基于变异图的序列比对和变异检测
:material-clock-fast: 时间复杂度
O(n log n)
:material-memory: 空间复杂度
O(n)
:material-code: 实现语言
C++

相关工具

Minigraph · GCSA2 · GraphAligner

标签

[variation-graph](tags.md#variation-graph) [alignment](tags.md#alignment) [variant-calling](tags.md#variant-calling) [pangenome](tags.md#pangenome)

:material-folder: 分类:图基因组学 / 变异图 | :material-identifier: ID:vg-toolkit