VG (Variation Graph)¶
2017年 图基因组学 变异图 高级 (Advanced)
VG (Variation Graph)
基于变异图的基因组分析工具包,将基因组序列和群体变异编码为有向图结构, 支持图上的序列比对和变异检测。该方法可处理参考基因组偏差,提供更公平 的比对和变异调用。
:material-target: 用途
基于变异图的序列比对和变异检测
:material-clock-fast: 时间复杂度
O(n log n):material-memory: 空间复杂度
O(n):material-code: 实现语言
C++
相关工具¶
Minigraph · GCSA2 · GraphAligner
标签¶
[variation-graph](tags.md#variation-graph) [alignment](tags.md#alignment) [variant-calling](tags.md#variant-calling) [pangenome](tags.md#pangenome)