Wtdbg2¶
2019年 序列组装 从头组装 进阶 (Intermediate)
Wtdbg2
基于模糊 de Bruijn 图的长读段组装工具，通过模糊边和模糊节点降低图的复杂度以加速组装。 该方法对 Oxford Nanopore 和 PacBio 长读段均有良好支持，组装速度极快且内存占用低。
:material-target: 用途
快速长读段从头组装
:material-clock-fast: 时间复杂度
O(n):material-memory: 空间复杂度
O(n):material-code: 实现语言
C
相关工具¶
Flye · Miniasm · Canu
标签¶
[long-read](tags.md#long-read) [fuzzy-bruijn](tags.md#fuzzy-bruijn) [fast](tags.md#fast) [nanopore](tags.md#nanopore)