表观基因组学¶
分析表观遗传修饰的算法
12 个算法收录于该分类。
ChIP-seq 分析 (ChIP-seq Analysis)¶
染色质免疫共沉淀测序分析
| 算法 | 年份 | 用途 | 难度 |
|---|---|---|---|
| HMMRATAC | 2019 | 基于 ATAC-seq 信号识别开放染色质区域 | - |
| Genrich | 2019 | ChIP-seq 和 ATAC-seq 数据的快速富集检测 | 进阶 |
| MACS2 | 2012 | ChIP-seq 数据的模型驱动峰值检测 | 入门 |
| ChromHMM | 2012 | 染色质状态自动发现和基因组注释 | - |
| DiffBind | 2011 | ChIP-seq 样本间的差异结合位点检测 | 进阶 |
| HOMER | 2010 | ChIP-seq 数据分析与转录因子基序发现 | 进阶 |
| MACS2 | 2008 | ChIP-seq 数据的峰值检测和富集分析 | - |
甲基化分析 (Methylation Analysis)¶
DNA 甲基化数据分析