基因表达分析¶
分析基因表达水平的算法
12 个算法收录于该分类。
表达定量 (Expression Quantification)¶
转录本和基因水平的表达量估计
| 算法 | 年份 | 用途 | 难度 |
|---|---|---|---|
| Salmon | 2017 | 快速准确的转录本定量 | - |
| tximport | 2016 | 转录本定量结果导入和基因水平汇总 | 入门 |
| Kallisto | 2016 | 快速转录本定量 | - |
| StringTie | 2015 | 转录本组装与丰度估计 | - |
| STAR | 2013 | RNA-seq 数据的剪接感知比对 | - |
| RSEM | 2011 | 基于参考的转录本定量 | - |
差异表达 (Differential Expression)¶
不同条件间的差异表达分析