功能注释¶
预测基因和蛋白质功能的算法
12 个算法收录于该分类。
同源性方法 (Homology-Based)¶
基于序列同源性的功能推断
| 算法 | 年份 | 用途 | 难度 |
|---|---|---|---|
| Bakta | 2021 | 细菌基因组的快速标准化功能注释 | - |
| KofamKOALA | 2020 | 基于 KEGG Ortholog 模型进行蛋白功能与通路注释 | - |
| OrthoFinder | 2019 | 基于直系同源群推断进行跨物种功能注释与基因家族分析 | - |
| eggNOG-mapper | 2017 | 基于直系同源关系的快速功能注释 | - |
| Prokka | 2014 | 快速自动化完成原核生物基因组功能注释 | - |
| BLAST-based Annotation | 1990 | 基于序列相似性的功能预测 | - |
结构域方法 (Domain-Based)¶
基于蛋白质结构域的功能注释