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基因预测

基因结构预测和基因组注释算法

12 个算法收录于该分类。

真核基因预测 (Eukaryotic Gene Prediction)

真核生物基因结构预测

算法年份用途难度
BRAKER2016全自动真核基因结构注释-
MAKER2008整合多源证据进行真核基因组注释-
AUGUSTUS2005真核生物基因结构从头预测进阶
SNAP2004基于半隐马尔可夫模型进行真核基因从头预测-
AUGUSTUS2003真核生物基因结构从头预测-

原核基因预测 (Prokaryotic Gene Prediction)

原核生物基因识别

算法年份用途难度
Prodigal2010原核生物蛋白编码基因快速预测-
Prodigal2010原核生物蛋白编码基因的快速从头预测入门
RNAmmer2007基因组中核糖体 RNA 基因的精确预测进阶
GeneMark-ES2005基于概率模型的多物种基因预测进阶
Glimmer1998原核基因组的开放阅读框和基因边界预测进阶
GLIMMER1998原核基因组中的开放阅读框与基因边界预测-
GeneMark1993基于统计模型进行基因结构与编码区预测-