蛋白质语言模型¶
基于大规模预训练模型的蛋白质分析算法
10 个算法收录于该分类。
蛋白质语言模型预训练 (Protein Language Model Pretraining)¶
蛋白质序列的语言模型和表征学习方法
| 算法 | 年份 | 用途 | 难度 |
|---|---|---|---|
| Ankh | 2023 | 高效轻量的蛋白质语言模型 | 进阶 |
| ESM-2 | 2022 | 基于 Transformer 的蛋白质序列表征学习 | 进阶 |
| ProtTrans | 2021 | 多架构蛋白质语言模型预训练表征 | 进阶 |
| ProtBERT | 2020 | 基于 BERT 的蛋白质序列表征学习 | 进阶 |
蛋白质功能预测 (Protein Function Prediction)¶
基于语言模型的蛋白质功能和性质预测
| 算法 | 年份 | 用途 | 难度 |
|---|---|---|---|
| RFdiffusion | 2023 | 基于扩散模型的蛋白质结构从头生成 | 高级 |
| ESMFold | 2023 | 基于语言模型的快速端到端结构预测 | 进阶 |
| ProteinMPNN | 2022 | 基于图神经网络的蛋白质序列设计 | 高级 |
| ESM-1v | 2021 | 基于语言模型的蛋白质变异效应零样本预测 | 进阶 |
| ProGen | 2020 | 条件可控的蛋白质序列生成 | 高级 |
| DeepSEA | 2015 | 基于深度学习的 DNA 序列功能预测 | 进阶 |