空间组学¶
保留空间信息的组学数据分析算法
10 个算法收录于该分类。
空间转录组学 (Spatial Transcriptomics)¶
空间分辨的基因表达分析方法
| 算法 | 年份 | 用途 | 难度 |
|---|---|---|---|
| stLearn | 2021 | 整合组织图像的空间转录组分析 | 进阶 |
| Squidpy | 2021 | 空间组学数据的图分析和图像整合 | 进阶 |
| Seurat Spatial | 2021 | 空间转录组数据的整合分析 | 进阶 |
| SPARK-X | 2021 | 快速非参数空间可变基因检测 | 进阶 |
| Giotto Suite | 2021 | 多平台空间组学综合分析框架 | 进阶 |
| SPARK | 2019 | 统计学方法检测空间可变基因 | 进阶 |
| SpatialDE | 2018 | 高斯过程方法检测空间表达模式 | 高级 |
空间蛋白质组学 (Spatial Proteomics)¶
空间分辨的蛋白质组分析方法