变异检测¶
检测基因组变异的算法
14 个算法收录于该分类。
单核苷酸变异 (SNV Detection)¶
检测单核苷酸变异和小型插入缺失
| 算法 | 年份 | 用途 | 难度 |
|---|---|---|---|
| DeepSomatic | 2024 | 基于深度学习的体细胞变异检测 | - |
| Clair3 | 2022 | 基于长读段数据进行高精度生殖系变异检测 | - |
| Octopus | 2021 | 贝叶斯单倍型感知的变异检测与联合推断 | - |
| Strelka2 | 2018 | 快速体细胞和生殖系变异检测 | - |
| DeepVariant | 2018 | 基于深度学习的高精度变异检测 | - |
| MuTect2 | 2013 | 检测体细胞 SNP 和小型 Indel 变异 | - |
| FreeBayes | 2012 | 基于贝叶斯的变异检测 | - |
| GATK HaplotypeCaller | 2010 | 检测 SNP 和小型 Indel 变异 | - |
结构变异 (Structural Variants)¶
检测大规模结构变异