Gene Prediction
Algorithms for gene structure prediction and annotation
12 algorithms in this category.
Eukaryotic Gene Prediction
Eukaryotic gene structure prediction
| Algorithm | Year | Purpose |
|---|---|---|
| BRAKER | 2016 | 全自动真核基因结构注释 |
| MAKER | 2008 | 整合多源证据进行真核基因组注释 |
| AUGUSTUS | 2005 | 真核生物基因结构从头预测 |
| SNAP | 2004 | 基于半隐马尔可夫模型进行真核基因从头预测 |
| AUGUSTUS | 2003 | 真核生物基因结构从头预测 |
Prokaryotic Gene Prediction
Prokaryotic gene identification
| Algorithm | Year | Purpose |
|---|---|---|
| Prodigal | 2010 | 原核生物蛋白编码基因快速预测 |
| Prodigal | 2010 | 原核生物蛋白编码基因的快速从头预测 |
| RNAmmer | 2007 | 基因组中核糖体 RNA 基因的精确预测 |
| GeneMark-ES | 2005 | 基于概率模型的多物种基因预测 |
| Glimmer | 1998 | 原核基因组的开放阅读框和基因边界预测 |
| GLIMMER | 1998 | 原核基因组中的开放阅读框与基因边界预测 |
| GeneMark | 1993 | 基于统计模型进行基因结构与编码区预测 |