Protein Language Model
Protein analysis using large-scale pre-trained models
10 algorithms in this category.
Protein Language Model Pretraining
Language models and representation learning for proteins
| Algorithm | Year | Purpose |
|---|---|---|
| Ankh | 2023 | 高效轻量的蛋白质语言模型 |
| ESM-2 | 2022 | 基于 Transformer 的蛋白质序列表征学习 |
| ProtTrans | 2021 | 多架构蛋白质语言模型预训练表征 |
| ProtBERT | 2020 | 基于 BERT 的蛋白质序列表征学习 |
Protein Function Prediction
Protein function and property prediction using language models
| Algorithm | Year | Purpose |
|---|---|---|
| RFdiffusion | 2023 | 基于扩散模型的蛋白质结构从头生成 |
| ESMFold | 2023 | 基于语言模型的快速端到端结构预测 |
| ProteinMPNN | 2022 | 基于图神经网络的蛋白质序列设计 |
| ESM-1v | 2021 | 基于语言模型的蛋白质变异效应零样本预测 |
| ProGen | 2020 | 条件可控的蛋白质序列生成 |
| DeepSEA | 2015 | 基于深度学习的 DNA 序列功能预测 |