蛋白质语言模型
基于大规模预训练模型的蛋白质分析算法
10 个算法收录于该分类。
蛋白质语言模型预训练
蛋白质序列的语言模型和表征学习方法
| Algorithm | Year | Purpose |
|---|---|---|
| Ankh | 2023 | 高效轻量的蛋白质语言模型 |
| ESM-2 | 2022 | 基于 Transformer 的蛋白质序列表征学习 |
| ProtTrans | 2021 | 多架构蛋白质语言模型预训练表征 |
| ProtBERT | 2020 | 基于 BERT 的蛋白质序列表征学习 |
蛋白质功能预测
基于语言模型的蛋白质功能和性质预测
| Algorithm | Year | Purpose |
|---|---|---|
| RFdiffusion | 2023 | 基于扩散模型的蛋白质结构从头生成 |
| ESMFold | 2023 | 基于语言模型的快速端到端结构预测 |
| ProteinMPNN | 2022 | 基于图神经网络的蛋白质序列设计 |
| ESM-1v | 2021 | 基于语言模型的蛋白质变异效应零样本预测 |
| ProGen | 2020 | 条件可控的蛋白质序列生成 |
| DeepSEA | 2015 | 基于深度学习的 DNA 序列功能预测 |