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统计仪表盘 ​

技术白皮书入口 ​

• 项目导读 — 知识库定位、愿景与建议阅读路径
• 学院路径 — 四级进阶课程体系与必读文献
• 参考文献与相关项目 — 按领域分类的经典论文、必读综述与竞品分析
• 演进思考 — 三阶段演进历史、技术债务与未来路线图
• CLI 工作流参考 — 完整命令手册与 CI/CD 集成指南

研究方向 ​

• 序列比对 — 用于比较和对齐生物序列的算法 (19 个算法)
• 序列组装 — 从短读段重建完整序列的算法 (14 个算法)
• 变异检测 — 检测基因组变异的算法 (14 个算法)
• 基因表达分析 — 分析基因表达水平的算法 (12 个算法)
• 蛋白质结构预测 — 预测蛋白质三维结构的算法 (14 个算法)
• 系统发育分析 — 构建和分析进化树的算法 (12 个算法)
• 功能注释 — 预测基因和蛋白质功能的算法 (12 个算法)
• 数据压缩 — 压缩生物信息学数据的算法 (10 个算法)
• 单细胞基因组学 — 单细胞水平的基因组和转录组分析算法 (15 个算法)
• 宏基因组学 — 微生物群落的基因组分析算法 (14 个算法)
• 表观基因组学 — 分析表观遗传修饰的算法 (6 个算法)
• 基因预测 — 基因结构预测和基因组注释算法 (12 个算法)
• 群体遗传学 — 分析群体遗传结构和进化的算法 (12 个算法)
• 空间组学 — 保留空间信息的组学数据分析算法 (10 个算法)
• 图基因组学 — 基于图结构表示和分析基因组的算法 (9 个算法)
• 蛋白质语言模型 — 基于大规模预训练模型的蛋白质分析算法 (10 个算法)

最新收录 ​

• DeepSomatic (2024) — 基于深度学习的体细胞变异检测
• Chai-1 (2024) — 多模态生物分子结构预测与药物发现
• Boltz-1 (2024) — 开源端到端生物分子结构预测
• AlphaFold3 (2024) — 统一预测蛋白质及生物分子复合体三维结构
• scVI-tools (2023) — 深度生成模型驱动的单细胞组学分析
• WFA2-lib (2023) — 波前算法的自适应超快速序列比对
• Verkko (2023) — 整合 HiFi 和 ONT 数据实现端粒到端粒组装
• Sniffles2 (2023) — 基于长读段数据进行高精度结构变异检测

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