分析表观遗传修饰的算法
6 个算法收录于该分类。
染色质免疫共沉淀测序分析
| Algorithm | Year | Purpose |
|---|---|---|
| HMMRATAC | 2019 | 基于 ATAC-seq 信号识别开放染色质区域 |
| ChromHMM | 2012 | 染色质状态自动发现和基因组注释 |
| MACS2 | 2008 | ChIP-seq 数据的峰值检测和富集分析 |
DNA 甲基化数据分析
| Algorithm | Year | Purpose |
|---|---|---|
| DSS | 2014 | 基于层次统计模型检测差异甲基化位点和区域 |
| methylKit | 2012 | 高通量甲基化测序数据的差异分析与注释 |
| Bismark | 2011 | 亚硫酸氢盐测序数据的比对和甲基化定量 |