DSS
基于贝塔二项分布层次模型的差异甲基化分析方法，可在生物学重复之间稳健估计离散度并检测 DMR。 该方法适用于全基因组和靶向亚硫酸氢盐测序数据，是比较不同条件甲基化变化的常用统计框架。
| 属性 | 值 |
|---|---|
| 用途 | 基于层次统计模型检测差异甲基化位点和区域 |
| 时间复杂度 | O(n * s) |
| 空间复杂度 | O(n) |
| 年份 | 2014 |
| 分类 | 表观基因组学 |
复杂度分析
- 时间复杂度：
O(n * s) - 空间复杂度：
O(n)
性能洞见：该算法时间复杂度属于多项式量级。空间复杂度线性，通常可通过滑动窗口等技术在常数因子上优化。
注：复杂度基于理论模型。实际性能受数据规模、硬件环境与实现优化影响，建议针对具体场景进行基准测试。
文献与实现
相关工具
methylKit · bsseq · Bismark