BioInfo Wiki

BioInfo Wiki 试图把生物学对象、计算模型、核心算法、分析流程和数据资源 连接成一张可以连续阅读的知识地图。 它不是工具参数手册，而是帮助读者理解“为什么需要这些方法、它们如何彼此连接”的项目。

如果你希望从一个稳定的中文入口理解 reads、比对、组装、HMM、RNA-seq、变异检测以及它们背后的共同方法主线， 这里就是起点。

为什么看这个项目

知识主干优先

从对象、模型和算法出发组织内容，而不是只罗列工具命令。

算法与流程相连

强调字符串、图、概率模型与真实分析流程之间的联系。

中文连续阅读

以简体中文为主，术语首次出现补充英文与缩写。

适合反复回查

通过交叉链接把概念、格式、资源和流程串联起来。

六个入口

导论 项目定位、学习路线、贡献方式与写作规范入口。

基础与数学 对象、抽象模型、算法基础与必要数学前置。

核心方法 索引、比对、组装、概率模型等核心方法主线。

分析方向 RNA-seq、变异检测、单细胞、长读长等主题入口。

数据与资源 参考基因组、注释、文件格式与数据库入口。

附录 术语、参考资料和索引性内容。

三条阅读路径

初学者路径

1. 导论
2. 基础与数学
3. 数据与资源
4. 分析方向

算法路径

1. 导论中的算法入口
2. 基础与数学
3. 核心方法
4. 回到分析方向验证方法位置

任务驱动路径

1. 选择一个分析方向
2. 回看相关数据与资源
3. 追溯到核心方法
4. 再补基础与模型

从哪里开始

项目导论 先了解项目定位、如何阅读，以及知识主干是怎样组织的。

学习路线 按背景和目标选择更合适的阅读顺序。

贡献方式 了解内容修改、结构调整和 OpenSpec 驱动协作方式。

项目主页、README 和 GitHub 仓库描述保持同一条叙事：这是一个服务中文社区、强调知识主干和连续阅读体验的生物信息学知识库。