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ASTRAL

基于基因树汇总方法的物种树估计工具,通过寻找与输入基因树最兼容的物种树来解决不完全谱系分选问题。 在多物种溯祖模型下具有理论保证,是基因组尺度系统发育学研究中的标准方法之一。

属性
用途基于基因树汇总的物种树估计
时间复杂度O(n * m)
空间复杂度O(n * m)
年份2018
分类系统发育分析

复杂度分析

  • 时间复杂度O(n * m)
  • 空间复杂度O(n * m)

性能洞见:该算法时间复杂度属于多项式量级。

注:复杂度基于理论模型。实际性能受数据规模、硬件环境与实现优化影响,建议针对具体场景进行基准测试。

文献与实现

相关工具

ASTRAL-III · ASTRID · MP-EST

标签

species-tree summary-method coalescent gene-tree

Released under the MIT License.