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Bayesian Phylogenetic Inference

基于贝叶斯统计框架的系统发育推断方法,使用马尔可夫链蒙特卡洛采样估计后验概率分布。 该方法能同时估计树拓扑、分支长度和模型参数的不确定性,适合分子钟和分歧时间估计。

属性
用途贝叶斯框架的系统发育推断和分歧时间估计
时间复杂度O(n^2 * s * r)
空间复杂度O(n * s)
年份2001
分类系统发育分析

复杂度分析

  • 时间复杂度O(n^2 * s * r)
  • 空间复杂度O(n * s)

性能洞见:该算法时间复杂度属于多项式量级。

注:复杂度基于理论模型。实际性能受数据规模、硬件环境与实现优化影响,建议针对具体场景进行基准测试。

文献与实现

相关工具

MrBayes · BEAST2 · RevBayes

标签

bayesian mcmc molecular-clock divergence-time

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