BLAST-based Annotation
基于序列相似性的功能注释方法，通过与已知功能序列数据库比对来推断未知序列的功能。 该方法是最基础和广泛使用的功能注释策略，适用于各类生物序列的初步功能预测。
| 属性 | 值 |
|---|---|
| 用途 | 基于序列相似性的功能预测 |
| 时间复杂度 | O(mn) |
| 空间复杂度 | O(m) |
| 年份 | 1990 |
| 分类 | 功能注释 |
复杂度分析
- 时间复杂度：
O(mn) - 空间复杂度：
O(m)
性能洞见：该算法时间复杂度属于平方矩阵（O(mn) 量级），在序列长度 n、m 均超过 10⁴ 时需评估 SIMD / 近似加速。
注：复杂度基于理论模型。实际性能受数据规模、硬件环境与实现优化影响，建议针对具体场景进行基准测试。
文献与实现
相关工具
BLAST+ · UniProt · InterPro