CRAM
专为比对数据设计的参考序列压缩格式，通过存储与参考序列的差异实现高压缩比。 该方法可将 BAM 文件压缩至原大小的 40-60%，是大规模测序项目的首选存储格式。
| 属性 | 值 |
|---|---|
| 用途 | 比对数据的高效压缩存储 |
| 时间复杂度 | O(n) |
| 空间复杂度 | O(r) |
| 年份 | 2011 |
| 分类 | 数据压缩 |
复杂度分析
- 时间复杂度：
O(n) - 空间复杂度：
O(r)
性能洞见：该算法时间复杂度属于线性（O(n) 量级），可在 TB 级数据上线性扩展，适合流式处理。
注：复杂度基于理论模型。实际性能受数据规模、硬件环境与实现优化影响，建议针对具体场景进行基准测试。
文献与实现
相关工具
samtools · htslib · cramtools