Skip to content

eggNOG-mapper

基于直系同源群(eggNOG)数据库的快速功能注释工具,使用预计算的进化系统树提高注释准确性。 该方法能高效注释大规模蛋白质组数据,提供 GO、KEGG 和 COG 等多种功能分类。

属性
用途基于直系同源关系的快速功能注释
时间复杂度O(n * m)
空间复杂度O(m)
年份2017
分类功能注释

复杂度分析

  • 时间复杂度O(n * m)
  • 空间复杂度O(m)

性能洞见:该算法时间复杂度属于多项式量级。

注:复杂度基于理论模型。实际性能受数据规模、硬件环境与实现优化影响,建议针对具体场景进行基准测试。

文献与实现

相关工具

InterProScan · BLAST+ · KofamKOALA

标签

orthology go-annotation kegg fast

Released under the MIT License.