eggNOG-mapper
基于直系同源群(eggNOG)数据库的快速功能注释工具,使用预计算的进化系统树提高注释准确性。 该方法能高效注释大规模蛋白质组数据,提供 GO、KEGG 和 COG 等多种功能分类。
| 属性 | 值 |
|---|---|
| 用途 | 基于直系同源关系的快速功能注释 |
| 时间复杂度 | O(n * m) |
| 空间复杂度 | O(m) |
| 年份 | 2017 |
| 分类 | 功能注释 |
复杂度分析
- 时间复杂度:
O(n * m) - 空间复杂度:
O(m)
性能洞见:该算法时间复杂度属于多项式量级。
注:复杂度基于理论模型。实际性能受数据规模、硬件环境与实现优化影响,建议针对具体场景进行基准测试。
文献与实现
相关工具
InterProScan · BLAST+ · KofamKOALA