FastTree
面向大规模多序列比对的近似最大似然建树工具，通过启发式搜索快速生成大规模系统发育树。 该方法在处理上万条序列时速度明显快于传统方法，是高通量进化分析和微生物组研究中的常用选择。
| 属性 | 值 |
|---|---|
| 用途 | 大规模序列集合的快速近似最大似然建树 |
| 时间复杂度 | O(n * s * log n) |
| 空间复杂度 | O(n * s) |
| 年份 | 2010 |
| 分类 | 系统发育分析 |
复杂度分析
- 时间复杂度：
O(n * s * log n) - 空间复杂度：
O(n * s)
性能洞见：该算法时间复杂度属于多项式量级。
注：复杂度基于理论模型。实际性能受数据规模、硬件环境与实现优化影响，建议针对具体场景进行基准测试。
文献与实现
相关工具
IQ-TREE · RAxML-NG · PhyML