GZIP for FASTQ
基于 DEFLATE 算法的通用数据压缩方法，广泛用于压缩 FASTQ 格式的测序数据。 该方法压缩比适中，兼容性好，是生物信息学数据存储的标准压缩格式。
| 属性 | 值 |
|---|---|
| 用途 | 测序数据的通用压缩 |
| 时间复杂度 | O(n) |
| 空间复杂度 | O(1) |
| 年份 | 1992 |
| 分类 | 数据压缩 |
复杂度分析
- 时间复杂度：
O(n) - 空间复杂度：
O(1)
性能洞见：该算法时间复杂度属于线性（O(n) 量级），可在 TB 级数据上线性扩展，适合流式处理。空间开销极小，适合内存受限的嵌入式或流式场景。
注：复杂度基于理论模型。实际性能受数据规模、硬件环境与实现优化影响，建议针对具体场景进行基准测试。
文献与实现
相关工具
gzip · pigz · bgzip