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IQ-TREE 2

高效的最大似然系统发育推断工具最新版本,新增分区模型和混合模型支持以适应异质进化过程。 集成 ModelFinder 自动选择最优替代模型,在大规模基因组数据集上表现优异且内存效率高。

属性
用途支持分区与混合模型的高效最大似然推断
时间复杂度O(n^2 * s)
空间复杂度O(n * s)
年份2020
分类系统发育分析

复杂度分析

  • 时间复杂度O(n^2 * s)
  • 空间复杂度O(n * s)

性能洞见:该算法时间复杂度属于多项式量级。

注:复杂度基于理论模型。实际性能受数据规模、硬件环境与实现优化影响,建议针对具体场景进行基准测试。

文献与实现

相关工具

RAxML-NG · PhyML · FastTree

标签

maximum-likelihood model-finder partition mixture-model

Released under the MIT License.