KofamKOALA
基于 KEGG Ortholog 隐马尔可夫模型配置文件的功能注释方法，可为蛋白序列快速分配 KO 编号和代谢通路信息。 该工具在灵敏度与精确度之间取得平衡，适合微生物基因组和宏基因组数据的高通量功能注释。
| 属性 | 值 |
|---|---|
| 用途 | 基于 KEGG Ortholog 模型进行蛋白功能与通路注释 |
| 时间复杂度 | O(n * m) |
| 空间复杂度 | O(m) |
| 年份 | 2020 |
| 分类 | 功能注释 |
复杂度分析
- 时间复杂度：
O(n * m) - 空间复杂度：
O(m)
性能洞见：该算法时间复杂度属于多项式量级。
注：复杂度基于理论模型。实际性能受数据规模、硬件环境与实现优化影响，建议针对具体场景进行基准测试。
文献与实现
相关工具
eggNOG-mapper · InterProScan · HMMER