Skip to content

MAFFT

基于快速傅里叶变换的多序列比对工具,使用 FFT 加速同源区域检测和比对优化。 该方法提供多种比对策略,能高效处理从数十到数万条序列的比对任务。

属性
用途高效多序列比对
时间复杂度O(n * L * log L)
空间复杂度O(n * L)
年份2002
分类序列比对

复杂度分析

  • 时间复杂度O(n * L * log L)
  • 空间复杂度O(n * L)

性能洞见:该算法时间复杂度属于多项式量级。

注:复杂度基于理论模型。实际性能受数据规模、硬件环境与实现优化影响,建议针对具体场景进行基准测试。

文献与实现

相关工具

MUSCLE · Clustal Omega · T-Coffee

标签

fft multiple-alignment scalable versatile

Released under the MIT License.