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Maximum Likelihood Phylogeny

基于最大似然法的系统发育推断算法,通过优化进化模型参数来寻找最可能的树拓扑。 该方法统计学基础扎实,能够提供可靠的分支支持度评估。

属性
用途统计学方法构建系统发育树
时间复杂度O(n^2 * s * r)
空间复杂度O(n * s)
年份2014
分类系统发育分析

复杂度分析

  • 时间复杂度O(n^2 * s * r)
  • 空间复杂度O(n * s)

性能洞见:该算法时间复杂度属于多项式量级。

注:复杂度基于理论模型。实际性能受数据规模、硬件环境与实现优化影响,建议针对具体场景进行基准测试。

文献与实现

相关工具

RAxML · IQ-TREE · PhyML

标签

maximum-likelihood statistical tree-building

Released under the MIT License.