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MetaPhlAn
基于标记基因的宏基因组物种组成分析工具，使用物种特异性标记序列精确量化微生物丰度。 该方法无需组装即可获得准确的物种丰度信息，内存占用低，适合大规模样本分析。
| 属性 | 值 |
|---|---|
| 用途 | 基于标记基因的微生物组成和丰度定量 |
| 时间复杂度 | O(n * m) |
| 空间复杂度 | O(m) |
| 年份 | 2012 |
| 分类 | 宏基因组学 |
复杂度分析
- 时间复杂度：
O(n * m) - 空间复杂度：
O(m)
性能洞见：该算法时间复杂度属于多项式量级。
注：复杂度基于理论模型。实际性能受数据规模、硬件环境与实现优化影响，建议针对具体场景进行基准测试。
文献与实现
相关工具
Kraken2 · mOTUs · HUMAnN