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MrBayes

基于 Metropolis 耦合马尔可夫链蒙特卡洛的贝叶斯系统发育推断软件,是该领域最经典的工具之一。 支持多种核苷酸和氨基酸替换模型,能够高效采样后验分布并评估系统发育树的不确定性。

属性
用途经典贝叶斯系统发育推断
时间复杂度O(n^2 * s * r)
空间复杂度O(n * s)
年份2012
分类系统发育分析

复杂度分析

  • 时间复杂度O(n^2 * s * r)
  • 空间复杂度O(n * s)

性能洞见:该算法时间复杂度属于多项式量级。

注:复杂度基于理论模型。实际性能受数据规模、硬件环境与实现优化影响,建议针对具体场景进行基准测试。

文献与实现

相关工具

BEAST2 · RevBayes

标签

bayesian mcmc metropolis-coupled classic

Released under the MIT License.