MrBayes
基于 Metropolis 耦合马尔可夫链蒙特卡洛的贝叶斯系统发育推断软件,是该领域最经典的工具之一。 支持多种核苷酸和氨基酸替换模型,能够高效采样后验分布并评估系统发育树的不确定性。
| 属性 | 值 |
|---|---|
| 用途 | 经典贝叶斯系统发育推断 |
| 时间复杂度 | O(n^2 * s * r) |
| 空间复杂度 | O(n * s) |
| 年份 | 2012 |
| 分类 | 系统发育分析 |
复杂度分析
- 时间复杂度:
O(n^2 * s * r) - 空间复杂度:
O(n * s)
性能洞见:该算法时间复杂度属于多项式量级。
注:复杂度基于理论模型。实际性能受数据规模、硬件环境与实现优化影响,建议针对具体场景进行基准测试。
文献与实现
相关工具
BEAST2 · RevBayes