PhyML
基于最大似然法的快速系统发育树构建工具，使用启发式搜索策略加速树拓扑的优化。该方法可自动选择最优的核苷酸或蛋白质替换模型。
| 属性 | 值 |
|---|---|
| 用途 | 快速最大似然系统发育推断 |
| 时间复杂度 | O(n^2 * s) |
| 空间复杂度 | O(n * s) |
| 年份 | 2003 |
| 难度 | 进阶 (Intermediate) |
| 实现语言 | C |
| 分类 | 系统发育分析 |
复杂度分析
- 时间复杂度：
O(n^2 * s) - 空间复杂度：
O(n * s)
性能洞见：该算法时间复杂度属于多项式量级。
注：复杂度基于理论模型。实际性能受数据规模、硬件环境与实现优化影响，建议针对具体场景进行基准测试。
文献与实现
相关工具
RAxML-NG · IQ-TREE · FastTree